Múzeum mesta Bratislavy má 11 tematických múzeí prevažne v historickom jadre mesta. Výnimkou sú hrad Devín a Múzeum Antická Gerulata v Rusovciach. Prvé tematicky inštalované expozície múzea vznikli v 20. až 30. rokoch 20. storočia v priestoroch Starej radnice, v Apponyiho paláci a rodnom dome J.N.Hummela. Rozširovanie ďalších expozícií múzea sa udialov 60. a 70. rokoch 20. storočia. V tomto období vznikla väčšina doteraz fungujúcich múzeí. Na začiatku 21. storočia vzniklo Múzeum Arthura Fleischmanna. V rámci celkovej obnovy Apponyiho paláca v rokoch 2005 - 2007 bolo otvorené popri znovu inštalovanému Múzeu vinohradníctva aj Múzeum historických interiérov. V roku 2011 sa sprístupnila po celkovej obnove Stará radnica kde má sídlo expozícia Múzea dejín mesta a Ateliér Múzeum má budúcnosť.
Múzeum dejín mesta sa nachádza sa v komplexe budov Starej radnice. Kladie dôraz na prezentáciu dejín obyvateľov Bratislavy na pozadí historických udalostí. Autori scenára: Mgr. Marta Janovíčková, Mgr. Zuzana Francová, PhDr. Elena Kurincová, PhDr. Štefan Holčík, CSc., Mgr. Anton Fiala.
Viete, ktorá časť Starej radnice je najstaršia? Ako k nej pribúdali ďalšie objekty,odkedy ju vlastní mesto? Apropo, viete, čo sa v nej dnes nachádza? Otázky smerujeme k potenciálnym návštevníkom. Odpovede nájdu priamo v Starej radnici. O dôvod viac navštíviť ju!
Múzeum vinohradníctva sa nachádza na prízemí a v suteréne Apponyiho paláca. Disponuje bezbariérovým prístupom do jednotlivých miestností expozície. V ponuke pre návštevníka je pripravený systém - audio guide. Autorka scenára expozície: Mgr. Soňa Štangová, PhDr. Regína Vidová
Múzeum historických interiérov sa nachádza na prvom a druhom poschodí Apponyiho paláca. Disponuje bezbariérovým prístupom do jednotlivých miestností expozície. V ponuke pre návštevníka je pripravený systém - audio guide. Autorka scenára expozície: Mgr. Marta Janovíčková. Odborná spolupráca: PhDr. Štefan Holčík
Múzeum je venované histórii opevnenia mesta, vystavené sú chladné zbrane, vojenská i turnajová výzbroj. Z najvyššieho poschodia je vchod na ochodzu veže, odkiaľ je výhľad na historickú časť Bratislavy a jej okolie.
Lekáreň U červeného raka je expozíciou Múzea farmácie a je umiestnená v časti priestorov bývalej lekárne na prízemí barokového meštianskeho domu. Michalská ulica 26, tel:+421 254 131 214
Múzeum prezentuje život a dielo bratislavského rodáka sochára Arthura Fleischmanna (1896-1990). Autorka scenára expozície: Mgr. Zuzana Francová. Biela ulica 6, tel: +421 254 131 211.
Rokokový dom U dobrého pastiera postavili v rokoch 1760 – 1765. Dom patrí k drobným skvostom stredoeurópskej meštianskej architektúry. Židovská 3, tel.:+421 254 411 940
V areáli múzea sa nachádzajú základy stavieb z 1. až 4. storočia. V exteriéri je prezentovaná neskoro-antická pevnosť zo 4. storočia, ktorá bola vstavaná do severného rohu pôvodného kastela. Vo výstavnej sieni sú umiestnené nálezy z archeologických výskumov. Autorka scenára expozície: PhDr. Jaroslava Schmidtová. Gerulatská 7; Rusovce, tel.: +421 262 859 332; e-mail: gerulata@centrum.sk; MHD: Most SNP, č. 91; 191
